第二十章 “烟酒僧”Routine（九）——论“课题”（中）21（1 / 2）

听完师兄师姐的“长篇大论”，魏泺和柳沅沉默了许久。直到顺际宁打了个“酣畅淋漓”的呵欠，魏泺才缓缓开口。

“那这‘突变体库’或者‘诱变’……”魏泺想了半天，也不清楚该如何表达，只好草草地收场，“具体是怎样的呀？”

师姐大概也没明白魏泺想要问些什么，只能依照自己的理解，笑着回答道：“找别人要现成的突变体，或者我们自己‘诱发’斑马鱼突变咯。然后进行最直接的‘表型’观察，看看这些鱼有没有长得‘与众不同’嘛！”

其实说起大型的“库藏”资源受益者，最令钱余羡慕的，当属陈幸和郭子昱。他俩都研究癌症，而那些医疗数据库收集的“资源”，大都包括癌症患者的基因组数据——癌症患者通常会出现某些肿瘤相关基因的突变，当这些基因呈现表达异常的时候，人类体内便可能出现肿瘤组织，继而形成癌症。这些患者对于其他“无瘤”的健康人来说，便算得上是“突变体”了。

现有的各大“资源库”，除却美国癌症基因组图谱数据库TCGA，还有源自欧洲的Oncomine癌症基因芯片数据库，国际癌症基因组数据库ICGC……再结合NCBI开发的高通量基因表达数据库GEO，以及基于上述数据库开发的各类网站、软件等等——譬如cBioPortal癌症基因组数据探索，UCSCXena基因组浏览器，miRCancer癌症小RNA数据库，TIMER肿瘤免疫浸润数据库，Kaplan-Meier生存曲线绘图仪，GEPIA数据库可视化网站……真可谓“数不胜数”。这些“工具”能够给使用者提供帮助，方便他们将各大数据库的数据，进行分类、汇总，大大节省了分析时间。因此，光是某一癌症的单一基因数据，就足够让癌症科研人员“眼花缭乱”。

若是课题组有条件，也可以选择“自行建库”——例如，将体外培养的癌细胞进行药物等特殊处理，交予生物公司做基因测序分析，再与对照组做对比，寻找感兴趣的“癌症相关因子”。

不过哪怕不去“建库”，肿瘤研究者从以上的数据库中，将同类型的数据自行做几个交集，也能多多少少筛选到“一星半点儿”的“候选”基因，有那么一些眉目。

其次能让钱余羡慕的，便是他的室友“植物学帅小伙”了。

帅小伙整日在温室的花丛中“拈花惹草”，实验操作愈发熟练。晚上回到宿舍，他也常跟钱余唠嗑，聊一聊拟南芥以及自己所做的工作。

千禧年伊始，人们就完成了野生型拟南芥Columbia-0的全基因组测序，于是SALK研究所着手对其基因组的各个基因，进行了T-DNA插入和鉴定，构建了一个较为完整的“突变体库”，并将突变体种子进行共享，让研究者们能够通过“拟南芥信息资源网站”TAIR（TheArabidopsisInformationResource）进行购买。

研究人员根据染色体号、基因名等，在网站上寻找自己需要突变体，然后加入购物车、下单，突变体种子就能从大洋彼岸运过来，经过海关检疫，最后来到自己的实验室。

“想要买哪个基因的突变体啊，只要课题组舍得付钱就行。”帅小伙给钱余做过科普，“其实在欧洲也有一个‘突变体库’，叫做‘uNASC’——欧洲拟南芥储存中心（EurasianArabidopsisStockCenter）。

只不过我们实验室在那儿买得比较少，多数都在TAIR购买。”

“事实上拟南芥研究了这么多年，那些常见的基因，基本都被研究‘透’了，像我做‘植物免疫’的也是如此。虽然还有一些功能未知的基因，但我们也不能凭空去‘瞎猜’它们的作用。如果贸然把这些突变体的种子通通都买回来，那不是浪费钱嘛——万一这些基因没有功能呢？”

“所以靠谱的方法呀，是我们自己拿野生型的拟南芥种子，进行‘EMS化学诱变’，然后筛选突变体，再进行基因鉴定。”

EMS，全称为“甲基磺酸乙酯”，是一种常用的化学诱变剂，能够诱发DNA分子产生较多的碱基突变。所以EMS属于致癌物，使用者必须做好安全防护。不过帅小伙总有些“大大咧咧”，拿他的话来说，也不外乎是“就把种子用EMS泡一泡”，如此简单。

“但是后面这筛选、鉴定的工序也挺繁琐的，还好拟南芥有‘生长周期短’这一优势，若是让我做其它的农作物啊，估计我要打‘退堂鼓’咯……”帅小伙感叹道。

就连我国的“天宫二号”环游太空，人们也在舱内给拟南芥留了“一席之地”，让它和水稻共享“太空之旅”——可见拟南芥在植物科学研究中的地位。

那么斑马鱼的“突变体库”又是怎样的情况呢？