第十八章 “烟酒僧”Routine(七)19(2 / 2)

首先需要进行分子鉴定,即提取该突变体基因组DNA,经PCR扩增后,将克隆产物送至生物公司进行测序,可明确该样品是否为突变体,并确认其突变位点信息。

由于基因的表达,通常包括DNA向mRNA的“转录”,以及mRNA“翻译”为蛋白质的过程。因此,该突变体DNA的改变,会在多大程度上影响后续的“转录”和“翻译”效果,需要进一步验证。

最后,还需辅助突变体的各类表型观察。其中最显而易见的,便是对比该突变体与正常的野生型个体,查看两者是否存在肉眼可见的“外貌”差异。

“提取斑马鱼基因组DNA,可以用成鱼的尾鳍。”钱余给魏泺做起了介绍,“将成鱼进行麻醉以后,再将尾鳍切下,不过该成鱼后续啊,需要进行单尾隔离饲养。”

“而斑马鱼突变体的突变基因表达水平,还需分别用整体原位杂交技术检测mRNA表达,Westernblot检测蛋白丰度。”

“那你这……”魏泺看了看钱余摆在桌上的样品,继续说道,“应该也做了不少突变体的蛋白鉴定了吧?”

“还有一些是‘转基因鱼’的蛋白样品,我干脆也一块儿做鉴定了。”

这时顺际宁走进了实验室,看到仅钱余一个人,就“霸占”了好几个电泳槽——这工作量可真是够呛。

他不禁感慨道:“要是上学期期末的时候,实验室没有买这台‘化学发光成像仪’啊,尹老师现在看到你这一排排的样品,估计会感觉‘无比肉疼’。”

“为啥呀?”魏泺感到很疑惑,“不就是多跑了几个样品嘛!”

钱余笑着回答:“师兄说的不是这些电泳槽,而是指‘显影’的方式。”

“这‘化学发光成像仪’啊,自带了‘CCD拍照成像系统’,可连接电脑,运用配套软件进行Western显影操作,如今深受科研人员的喜爱。”顺际宁解释道,“不过这传统的显影方式呢,用的则是‘X-光胶片’。”

“化学发光”的原理其实也很简单,目前Western最常用的“化学发光底物”是辣根过氧化物酶HRP。通用的商业抗体“二抗”通常以HRP标记,当完成抗体孵育、进行显影之前,需要在“印迹纸”上加入“化学发光液”——其中A液为“鲁米诺”,又称“发光氨”;B液为“过氧化氢”。此二者混合后,再与结合了HRP标记抗体的“印迹纸”一起孵育,产生化学反应而生成的反射光,可以在425nm条件下,通过“X-光胶片”或者“化学发光成像仪”采集图像。

魏泺想了一会儿,开口道:“我记得课本里有介绍过,好像需要什么‘X-光片夹’,然后‘曝光’什么的。但具体的操作嘛……”

“那你有没有‘冲洗’过照片呀?”顺际宁又问魏泺,“就是最传统的、用‘黑白胶卷’冲洗的那种照片。”

魏泺摇了摇头:“没有,我只在电影和电视剧里看到过。大概是……要进到一间不透光的屋子,貌似叫什么‘摄影暗房’之类的。”

顺际宁抬起右手,朝门外指了指:“看到转角的那间‘暗室’了吗?”

魏泺转过头一看,又接着点了点头,问道:“那不是‘杂物房’么?刚开学的时候,我帮实验室管理员搬旧书,还进去过一次。那里面‘乌漆嘛黑’的,墙壁都涂黑了,而且还铺了一层厚厚的报纸——简直就是一间‘小黑屋’嘛!”

“那就是我们实验室之前,用来进行显影的‘暗房’啊。”顺际宁进一步介绍道,“将Western的‘印迹纸’加入‘化学发光液’之后,便将其收入到‘X-光片夹’中,带入暗房内。在黑暗环境下,将‘X-光胶片’置于‘印迹纸’上进行‘曝光’,时间自定。到点之后呀,就将该‘X-光胶片’迅速没入‘显影液’中显影,待有条带出现后,再浸入‘定影液’中,最后放入清水中洗去残留液体,就大功告成啦!”

钱余补充道:“其实跟‘冲洗照片’是一样的,就是简单的‘曝光’、‘显影’、‘定影’、‘水洗’这几步。不过呢,不需要像‘洗胶卷’那样,将其进行‘放大’处理。”

钱余刚进实验室那会儿,大伙用的都是‘X-光胶片’,所以每次显影,他都必须把自己“关进暗房里”。

“其实两种‘显影方式’都是可行的,只不过传统的‘X-光胶片’显影,需要自行控制曝光时间。不像现在的这台‘化学发光成像仪’,在‘化学发光液’作用的有效时限内,通过调整‘显影系统’的曝光时间梯度,可得出数张不同时间的曝光蛋白图,供科研人员随意选择并储存,若是曝光时间不理想,还能再次进行调整。只要‘化学发光作用’尚未‘淬灭’,可以随时调整曝光时间,直到令你满意为止。”

顺际宁继续说道:“可是这传统的显影方法,那就没这么‘自动化’了。每次显影,我们都是要随身带着‘计时器’的。特别是刚开始的时候,手生得很,一张片子大概需要曝光多久,都需要我们慢慢地摸索经验——蛋白的上样量、转膜效果、抗体的效价等,都决定了曝光的时间长短。信号强的话,所需的曝光时间就短,若是稍微多了几秒钟,那显影后得到的蛋白图啊,就是‘黑糊糊’的一片,别提有多难看了。”

“我们实验室用的一直都是佳能的‘X-光胶片’,那东西可不便宜啊。每次实验通常先‘压片’曝光一张,若是效果不佳,那就只能‘再接再厉’了。你看你师兄今天‘跑’了这么多个电泳槽子,要是有那么几张需要重新‘曝光’的话,那这一盒‘X-光胶片’啊,可就要用去了‘小一半’咯。”

钱余听了顺际宁的调侃,也无奈地自嘲道:“确实是啊,要是我再‘手残’一点,尹老师估计会是‘滴血的心在地上打滚’的状态。”

三人都默默地笑了。

“你和柳沅算是赶上‘好时候’了,现在‘显影’啊,再也不用被关进‘小黑屋’里咯……”

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